El objetivo de peruflorads43 es brindar a los usuarios una forma cómoda de acceder y analizar información sobre las especies de plantas incluidas en la “Clasificación Oficial de Especies Amenazadas de Flora Silvestre en el Perú”. Este paquete incluye funciones para buscar coincidencias parciales de los nombres de las especies.
Instalación
La version estable de peruflorads43 puede ser instalada desde CRAN, con la ayuda de:
install.packages("peruflorads43")
# or
pak::pak("peruflorads43")Para instalar la versión en desarrollo de peruflorads43 desde GitHub, se puede utilizar el siguiente comando :
pak::pak("PaulEsantos/peruflorads43")Comentarios
1.- En relación a la información contenida en el listado de especies, se ha identificado el registro duplicado de la especie Bishopanthus soliceps, la cual se encuentra en peligro crítico.
2.- Asimismo, se han detectado errores en la escritura de los nombres de las algunas especies, se corrigieron estos errores para asegurar la precisión de la información en incorporada en peruflorads43.
#> # A tibble: 20 × 2
#> listed_name correct_name
#> <chr> <chr>
#> 1 Ascidiogine wurdackii Ascidiogyne wurdackii
#> 2 Proboscidea altheaefolia Proboscidea althaeifolia
#> 3 Jaltomata mioneii Jaltomata mionei
#> 4 Larnax macrocalix Larnax macrocalyx
#> 5 Larnax sagastegui Larnax sagasteguii
#> 6 Solanum chuquidenum Solanum chiquidenum
#> 7 Mutisia wurdacki Mutisia wurdackii
#> 8 Peltogyne altisima Peltogyne altissima
#> 9 Solanum huancabambese Solanum huancabambense
#> 10 Salvia opossitiflora Salvia oppositiflora
#> 11 Ligeophila spp. Ligeophila
#> 12 Masdevallia zebraceae Masdevallia zebracea
#> 13 Telipogon alegria Telipogon alegriae
#> 14 Aspasia psitticina Aspasia psittacina
#> 15 Gongora quinquinervis Gongora quinquenervis
#> 16 Maxillaria rotumdilabia Maxillaria rotundilabia
#> 17 Mormodes revolutum Mormodes revoluta
#> 18 Mormodes rolfeanum Mormodes rolfeana
#> 19 Trichopilia fragans Trichopilia fragrans
#> 20 Trichopilia juninense Trichopilia juninensis3.- La lista de especies se ha reducido debido a la actualización de la información taxonómica. Se han identificado especies que fueron registradas con nombres diferentes en el momento de la elaboración del listado, y en la actualidad se ha unificado el nombre utilizado para referirse a ellas. Por lo tanto, se ha producido una reducción en el número de especies listadas, pero se ha mejorado la precisión y consistencia de la información en peruflorads43.
#> # A tibble: 10 × 2
#> species_name accepted_name
#> <chr> <chr>
#> 1 Ceroxylon crispum Ceroxylon vogelianum
#> 2 Ceroxylum verriculosum Ceroxylon vogelianum
#> 3 Comparettia coccinea Comparettia coccinea
#> 4 Comparettia peruviana Comparettia coccinea
#> 5 Geonoma undata Geonoma undata
#> 6 Geonoma weberbaueri Geonoma undata
#> 7 Lycaste ciliata Lycaste ciliata
#> 8 Lycaste fimbriata Lycaste ciliata
#> 9 Mila caespitosa subsp. caespitosa Mila caespitosa
#> 10 Mila caespitosa subsp. densiseta Mila caespitosa4.- Para las especies listadas bajo la categoría de forma:
- Haageocereus acranthus subsp. olowinskianus forma clavispinus (Rauh & Backeberg) Ostolaza
- Haageocereus acranthus subsp. olowinskianus forma repandus (Rauh & Backeberg) Ostolaza
- Haageocereus acranthus subsp. olowinskianus forma rubriflorior (Rauh & Backeberg) Ostolaza
Estos registros se unifican bajo Haageocereus acranthus subsp. olowinskianus.
- Haageocereus pseudomelanostele subsp. setosus forma longicomus (Akers) Ostolaza pasa a ser sinónimo de la especie Haageocereus multangularis.
5.- La información taxonómica de las siguientes especies se conserva respecto del listado original, debido a que no se cuenta con suficiente información para la determinación des estado de identificación.
- Corryocactus quadrangularis
- Epidendrum pardothyrsus
- Myrosmodes paludosum
- Prosthechea cyperifolia
- Stanhopea haselowiana
6.- Se tiene incluido en el listado un el genero Ligeophila.
Como usar peruflorads43
library(peruflorads43)
#> This is peruflorads043_2006_ag 0.1.1-
search_ds043esta fucnion puede ser empleada con un vector o data.frame:
# vector
splist <- c("Cleistocactus clavispinus",
"Welfia alfredi",
"Matucana hayneii")
search_ds043(splist = splist)
#> [1] "Present" "" "P_updated_name"
# data.frame
df <- data.frame(splist = splist)
df
#> splist
#> 1 Cleistocactus clavispinus
#> 2 Welfia alfredi
#> 3 Matucana hayneii
df$ds_043_2006 <- search_ds043(df$splist)
df
#> splist ds_043_2006
#> 1 Cleistocactus clavispinus Present
#> 2 Welfia alfredi
#> 3 Matucana hayneii P_updated_name
# tidyverse - tibble
df <- tibble::tibble(splist = splist)
df |>
dplyr::mutate(ds_043_2006 = search_ds043(splist))
#> # A tibble: 3 × 2
#> splist ds_043_2006
#> <chr> <chr>
#> 1 Cleistocactus clavispinus "Present"
#> 2 Welfia alfredi ""
#> 3 Matucana hayneii "P_updated_name"-
category_ds043_2006()permite la identificación de la categoría en la cual esta incorporada la especie.
category_ds043_2006(splist = splist)
#> name_submitted category accepted_name
#> 1 Cleistocactus clavispinus En peligro critico Cleistocactus clavispinus
#> 2 Welfia alfredi <NA> <NA>
#> 3 Matucana hayneii Vulnerable Matucana haynei
#> accepted_family
#> 1 Cactaceae
#> 2 <NA>
#> 3 Cactaceae